Italijai įsitraukus į karą, Alfa Romeo susidūrė su įvairiausiomis organizacinėmis problemomis. Tiekėjų rasti darosi vis sunkiau, gamyklos tris kartus (1940, 1943 ir 1944 metais) bombarduojamos. Paskutinis bombardavimas 1944 metais privertė beveik visiškai nutraukti Portello gamybinę veiklą. 1945 metais darbai po truputį prasidėjo iš naujo, imta gaminti variklius laivams, lėktuvams ir netgi modernias bei originalias elektrines virykles. Automobilių gamyba atnaujinta su gražiąja 6C 2500 ir nerūdijančia 158, kuri 1950 metais, padarius keletą išorinių pakeitimų bei nemažai patobulinus variklį, tapo 159. Alfa Romeo išsigydė karo žaizdas, o Biondetti pergalė Mille Miglia lenktynėse tapo pačiu reikšmingiausiu šio atgimimo simboliu. Kompanija dar kartą suvaidino lemiamą vaidmenį gamindama įspūdingojo 2500 modelio “specialiąją laidą” su Pininfarinos sukurtu Touring stiliaus kėbulu. 1950 metais Alfa susigrąžino pramoninį ir sportinį apyvartumą.